相比一、二代试管，三代试管婴儿会更先进、安全，且成功率更高，但在临床上还是有一定的弊端，如易损伤胚胎、费用昂贵、可移植胚胎少，而且部分女性在治疗过程中还可能留下卵巢过度刺激综合征、卵巢早衰、月经不调等后遗症，这让很多患者都有所担忧，但其实只要在正规医院进行治疗的话，这些风险都是很小的。

第三代试管婴儿也称胚胎植入前遗传学诊断，是一项以优生优育为目的的生殖医学技术，该技术在胚胎移植前，进行遗传物质分析，筛选出健康胚胎进行移植，从而防止遗传病的发生，比较适用于男女双方或一方患有遗传性疾病、有习惯性流产史等患者，目前三代试管婴儿技术已经相对成熟，但仍有一定的未知风险存在。

弊端

1.易损伤胚胎：三代试管婴儿胚胎染色体筛查技术，是将胚胎的细胞组织取下一部分，用于活检，而活检对胚胎是有一定的伤害的，可能会导致胚胎着床率降低、发育异常，这也是其最主要的技术缺陷之一；

2.费用昂贵：由于三代试管婴儿采用了较为先进的胚胎筛查技术，虽然可以提高移植成功率，但由于筛查过程是非常复杂的，并且需要筛查多个胚胎，其价格也是非常昂贵的，可能会增加家庭负担；

3.可移植胚胎少：三代试管一般都需要养囊，所以如果精子和卵子的质量不是特别好，就会导致胚胎质量差，很可能会出现养囊失败的情况，导致可移植胚胎少，甚至可能无胚胎可移植。

后遗症

1.多囊卵巢综合征女性在三代试管促排卵时，可能会出现卵巢过度刺激综合征，出现腹水、腹痛等症状，严重者可能会出现血液浓缩、血栓形成等；

2.由于卵泡刺激使得卵巢功能可能出现异常，部分女性做完试管婴儿后可能导致卵巢功能减退或早衰、月经不调等现象，严重者可能会导致闭经；

3.**过程时，如果不小心伤到膀胱就可能会留下一些后遗症，主要症状为腹痛，恶心，呕吐等症状，而且还有可能会出现宫外孕；

4.三代试管术后如果未能调节好心态，可能会出现心理因素导致的后遗症，由于疼痛等刺激会造成紧张情绪，或造成性生活不适。

虽然三代试管有一定的缺点，但是其优点还是很明显的，能更加有效地筛选出具有遗传疾病以及染色体异常的胚胎，降低了存在生理缺陷的胎儿，该技术具有PGS以及PGD技术，前者能针对查23对染色体进行筛选，后者可以帮助诊断125种遗传方面的疾病，能做到更好的优生优育。